Я относительно долго не мог понять в чем же дело и куда вообще копать. 
Решение оказалось очень неожиданным. Оказывается успешной сборке модулей ядра мешает установленная переменная окружения GREP_OPTIONS. Причем обычной компиляции данная переменная никак не мешала. 
Если вы вдруг столкнулись с такой же проблемой, проверьте, не задана ли у вас эта переменная и в случае необходимости удалите её: unset GREP_OPTIONS
Разумеется данная выгрузка отрабатывает только для текущего терминала, но этого достаточно для успешной сборки модуля.
Такая вот необычная проблема и не менее необычное решение. 
Может быть кому-то известна причина такого поведения и иные способы решения проблемы?

Спасибо. Надеюсь данная заметка кому-то будет полезна.

Update:
Последние сообщения при сборке модуля выглядели так:
Building modules, stage 2.
MODPOST 0 modules